イベント内で"第二話　フラグ2"をtrueにしたことで、
処理が終わったあとにイベントを消す場合、


↑と有効条件に書いたということだと思います
この考え方であってます
スクリプト内にも間違って書かれている場所が見当たりません
(一行目のgetFlag("第二話　フラグ2")は何も機能していませんが)

よくあるミスは、フラグ名の中のスペースや数字の全角/半角が間違っている
これを確認してミスがなかった場合は、違う原因があると思います
またお話を詳しく伺うことになると思います

また、応急処置として、イベントを見えなくすることもできます
透明のイベントをマップに登録して、
イベント操作関連▼
イベントのキャラクターの変更▼
で透明イベントにグラフィックを変更します
公開されている透明イベント

イベント内で"第二話　フラグ2"をtrueにしたことで、
処理が終わったあとにイベントを消す場合、

getFlag("第二話　フラグ2")

↑と有効条件に書いたということだと思います
この考え方であってます
スクリプト内にも間違って書かれている場所が見当たりません
(一行目のgetFlag("第二話　フラグ2")は何も機能していませんが)

よくあるミスは、フラグ名の中のスペースや数字の全角/半角が間違っている
これを確認してミスがなかった場合は、違う原因があると思います
またお話を詳しく伺うことになると思います