おそらく2DRPGでの事だと思いますが。

ゲームのジャンルごとに、各種仕様や使用可能な関数などが
多少変わってくるので、質問の際にはそれを意識して頂けると幸いです。


さて、戦闘シーンでコマンドを選択したりするのは
Rmake側で用意されているシステムであるため、
私たちユーザー側からどうこうすることは出来ないと思われます。

ランダムエンカウントを廃止して、
戦闘前に戦闘中使えないアイテムを全て没収、
（この時２次元配列にアイテムIDと個数を記録しておく）
戦闘後に再び配布、みたいなことも出来なくは無いような気はしますが、
恐ろしく現実的ではない案ですねぇ。