すみません、前言撤回します。
エンカウント率はおっしゃる通りに
イベントを使うことによって調整できました。
なのでエンカウント率の改善は特に必要ないです。

問題は逃亡成功率が常に0%と言うことですが……。

丁寧な回答ありがとうございます。
かなりムラのある方式だったんですね。
エンカウント率はRPGの肝だと思っているので、
検討のほう、よろしくお願いします。

Rmakeのご利用ありがとうございます。

現在の2DRPGのランダムエンカウントの確率の計算は
1回の描画（1frame）につき0.5%の確率で戦闘が発生します。
描画は大体1秒に30回おこないます。
（処理落ちしているときは描画回数は減ります。）
立ち止まっているときは計算しません。

＞一歩ずつエンカウント率が上がって、
＞戦闘に勝利するとリセットされる（逃亡はリセットされない）、
＞と言うのは無理でしょうか？

実現するにはRmake側の実装の変更が必要と考えております。
エンカウントの計算方法の選択など
Rmakeの改善項目として検討はしたいと思います。

あと、イベントの戦闘でランダムエンカウントっぽくする
方法については以下を参考にしてください。
http://rmake.jp/boards/2/topics/139

逃亡の成功率は現在一律で50%です。
これも変更するにはRmake側の実装が必要と考えています。
ただし、イベントで戦闘を開始した場合は逃げられません。

よろしくお願いします。