キャラクター/エネミーが武器に何も装備していない場合に起こる現象と思われます。
自分で武器を作成する場合、
１．アイテム・魔法エディタを開き、新規作成するを選択
２．名前と表示名だけは確実に記入して、編集するを押す
３．詳細設定を開き、武器を選択
４．（近接武器と仮定しますが）レベルを任意の値に変更（この値によって、ほかの数値を変更できる量が変わる）
５．近接→敵→コストなし→コスト0に設定
６．ポイントの残量が０になるまで自由に、ほかの値を弄り、okを押す
７．アイテムの基本情報に戻り、フィールドアイコンとメニューアイコンの設定をする
→クリップした画像を設定する→任意のものを選ぶ
＊クリップについては　https://rmake.jp/wikis/408
８．アニメーション設定に行き、同様に設定する
これで武器ができます。

この後、あとからキャラクターに、ゲーム開始後のスクリプトで装備させるか、キャラクターの初期装備させるかによって変わるので、そこを教えていただきたいです

キャラクター/エネミーが武器に何も装備していない場合に起こる現象と思われます。
自分で武器を作成する場合、
１．アイテム・魔法エディタを開き、新規作成するを選択
２．名前と表示名だけは確実に記入して、編集するを押す
３．詳細設定を開き、武器を選択
４．（近接武器と仮定しますが）レベルを任意の値に変更（この値によって、ほかの数値を変更できる量が変わる）
５．近接→敵→コストなし→コスト0に設定
６．ポイントの残量が０になるまで自由に、ほかの値を弄り、okを押す
７．アイテムの基本情報に戻り、フィールドアイコンとメニューアイコンの設定をする
→クリップした画像を設定する→任意のものを選ぶ
＊クリップについては　https://rmake.jp/wikis/408
８．アニメーション設定に行き、同様に設定する
これで武器ができます。

この後、あとからキャラクターに、ゲーム開始後のスクリプトで装備させるか、キャラクターの初期装備させるかによって変わるので、そこを教えていただきたいです