おそらく、レイヤーを１つだけしか使っていないからではないでしょうか？
レイヤーには０と１の２種類あり、０の上に１が乗っかるという感じになります。

レイヤー０には草や海等のチップを
レイヤー１には家具等のチップを置くと黒くなりません。

詳しくはコチラの〝レイヤーについて〟を参考にしてください。